GTF虽然比较古老，但确实有些软件（即使是最近的，例如SQANTI）会用到。转换的方法可能有各种各样，下面给出我实践过可行的方法：
一、GFF3转成GTF
gffread old.gff3 -T -o new.gtf二、GTF转成GFF3
gt gtf_to_gff3 old.gtf >new.gff3可能有人会问GFF3转成GTF为什么不用gt gff3_to_gtf？主要问题在于这样子会把ID编号全部丢掉（我手头上的v1.5.8），所以不用了。
分类： Biology Science
PharmGKB数据库中的基因下载页面
PharmGKB有一个隐藏得很深的基因下载页面，在这里可以下载获得各种excel格式的Haploid定义表、功能表、频率表等。
URL是：https://www.pharmgkb.org/page/cyp2a6RefMaterials，把其中的cyp2a6替换成自己要的基因即可。不是每个基因都有，看运气。
从ENA下载SRA
最近（2020年以来），Aspera（ascp）无法从NCBI下载SRA了，但是可以用ENA下载。现在以（SRR10609482）为例：
第一步：获取准确链接
访问https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SRR10609482，获取准确链接如下：
ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR106/082/SRR10609482/SRR10609482_1.fastq.gz
ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR106/082/SRR10609482/SRR10609482_2.fastq.gz可以看出中间出现了一个奇怪的三位数082。
一些有意思的SNP
（一）参考基因组为minor allele
很多情况下，人类参考基因组上的碱基是major allele。但也有相当多的情况下，它们是minor allele，有时甚至是rare allele。
BRCA2基因上有一个变异位点编号为rs169547，为非同义突变。全世界98%的人都是等位基因C，只有2%的人是等位基因T。
但是参考基因组上的等位基因是T（GRCh37和38都是），这纯属侥幸。