作为一个科学工作者，不能老灌水。有时候也写点专业的文章吧！
虽然标题写得很大很空洞，但这个问题是无解的——因为永远有未知的物种在等着你。那么我们换一个更加实际的问题：世界上有多少已知的生物物种呢？
分类： Biology Science
使用 Vue 开发生物信息学数据库的体会
这不是教程，而是我的随笔✏️
自从前年刚入职的时候猛干 7 天 Flask 开发之后，我就感觉 Flask 做后端还马马虎虎，做前端实在是在笨重了。所以萌生了上框架的想法。早在 2017 年时我就曾经尝试看 Vue 教程，结果因为看不懂放弃了，有点可惜。去年开始开发新项目时，知道这个项目负责，不上框架很可能搞不定。于是硬着头皮学习 Vue3，配个 ChatGPT 的帮助，终于搞定了。
用 chatGPT API 武装了一下 macOS
3月1日（日本时间则是3月2日） chatGPT API 发布，从此不用每次都傻傻地打开那个聊天窗口一问一答，而是可以把 AI 服务更加无缝地结合在自己的电脑里。当然这不是永久免费使用的，只是给了每个新注册账户（必须要非中国的手机号认证！）18美元的免费额度，看样子好像是4月1日到期，不确定后面是否还有。
7天用 Flask 开发完一个生物信息学数据库的体会
这不是教程，而是我的随笔✏️
以前，做普通计算时用 Perl，开发数据库网页后台却用 PHP，然后前端还要用 JavaScript，简直要把人折腾死。后来普通计算从 Perl 转到 Python，发现 Python 有个工具叫做 Flask 可以代替 PHP 作为网页后台，那就方便了，能省用一种语言。
第一个 Flask 开发的工具是 2019 年刚开始学 Python 时开发的一个 Pipeline，不涉及数据库查询，只是接收输入、后台计算，得到结果，页面只有一个，比较简单。
收到了来自国外的快递🏣：我会被传染新冠🦠吗？
最近各地几起病例都找不到源头，于是就甩锅给境外邮件。上面一甩锅，下面就得执行，小区门口马上设立“入境邮快件接收点”和“境外快递包装📦弃置桶”，以显示认真尽责的态度。按现在的规定：境外快递的收件人必须在接收点实名登记、戴着手套🧤和护目镜🥽，当场拆封、消毒、丢弃外包装。
最难懂的中学语文课文之一《这个世界的音乐》
这篇文章出现在我上高一时的语文书上（人教版2003版）。原作者是托马斯·刘易斯（Lewis Thomas），来自他的著作《细胞生命的礼赞——一个生物学观察者的手记》（1974年）（The Lives of a Cell: Notes of a Biology Watcher）。翻译者是湖南科学技术出版社《第一推动丛书》。该文章的英文原名叫做：The Music of This Sphere，中文译名：《这个世界的音乐》。难点在文章的最后一段，我当时的语文老师直言：怎么看都看不懂。
英文原文发表在著名的《新英格兰杂志》上（New England Journal of Medicine）。中文原文由于官方不公开，我只好从第三方随便搞一个。
下面我就把课本上的中文译文和英文原文对照起来一起展示。
GTF与GFF3的相互转换
GTF虽然比较古老，但确实有些软件（即使是最近的，例如SQANTI）会用到。转换的方法可能有各种各样，下面给出我实践过可行的方法：
GFF3转成GTF
gffread old.gff3 -E -F -T -o new.gtf
# -F preserve all GFF attributes (for non-exon features)
# -E show all warningsGTF转成GFF3
gffread old.gtf -E -F --keep-genes -o new.gff3可能有人会问GFF3转成GTF为什么不用gt gff3_to_gtf？主要问题在于这样子会把ID编号全部丢掉（我手头上的v1.5.8），所以不用了。