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把物理服务器的 CentOS 7 升级到 Ubuntu 24,惊心动魄

工作单位有一台服务器购买于 2020 年,安装的是 2020 年发布的 CentOS 7.8 系统。但其实 CentOS 7.0 是在 2014 年发布的,7.X 的大部分 package 版本都很老,实际上使用起来非常困难。众所周知 CentOS 7 在这个星期(2024年6月30日之前)就结束支持了,整个 CentOS 项目也寿终正寝。上级管理员让我们想对策,我就决定换成 Ubuntu 24.04 LTS,毕竟 LTS 之间升级起来比较方便!

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Google Adsense 使用体会

申请

之前尝试申请过三次(2021年初、今年初和今年9月),均失败,给的理由五花八门,有时说“有重复账号”,有时说“内容不足”。这次是用一个新的google账号去申请,并且填的是日本的真实住址。大约过了五个工作日,收到邮件(10月29日)说审批通过了,心里美滋滋的。

ads.txt文件问题

Posted in: PC/macOS

惨痛教训:macOS 中病毒

现如今电脑中病毒并不会蓝屏、弹窗之类,毕竟这也太明显了。它们只会在后台默默消耗你的 CPU 。对于笔记本电脑而言这可是很致命的,毕竟消耗 CPU 就等于消耗电池。

前段时间我发现 macbook M1 耗电特别快。按说 M1 应该是很省电的。查看后台发现有一个进程显示 CPU 一直 100%:

./MP -p /Library/taled/taled.app/Contents/MacOS/taled -o /Library/taled/taled.app/Contents/MacOS/taled

Google上只能搜到很少的信息,而且我学会了一个单词:电脑病毒有时不叫 virus,而叫 malware

直接删除了事,耗电量马上恢复正常了。病毒是怎么来的,很可能是前段时间安装破解软件导致的。

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从ENA下载SRA

最近(2020年以来),Aspera(ascp)无法从NCBI下载SRA了,但是可以用ENA下载。现在以(SRR10609482)为例,官方教程在此:

版本问题

目前 Aspera(ascp)最新的是4.2.X版,但是它有个问题是不存在 .aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh 这个文件,所以需要找老版本。遗憾的是官网下载老版本需要注册登录账号,因此这里提供一个 URL 解析的结果,下载 3.11.2 版:

https://d3gcli72yxqn2z.cloudfront.net/connect/bin/ibm-aspera-connect-3.11.2.63-linux-g2.12-64.tar.gz

步骤

获取准确链接

访问https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SRR10609482,获取准确链接如下:

ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR106/082/SRR10609482/SRR10609482_1.fastq.gz
ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR106/082/SRR10609482/SRR10609482_2.fastq.gz

可以看出中间出现了一个奇怪的三位数082

Posted in: Biology Science

生信者的 Windows PC

在过去的一年,历经波折,本以为要离开生信者行业,最后绕了一圈还是绕回来了。好在:博客不用改名了! 🙂

在上研究生的五年期间,作为一个生信者,个人的工作 PC 安装了 Ubuntu Linux 操作系统,当时最直接的原因是不想用 WIndows 下丑陋的 putty 作为 SSH 客户端来连日连夜的工作。页面丑、中文支持不好、X 支持不好……反正是各种毛病。再加上当时刚接触 Linux,自然也想需要有一个能够自己操控的平台用于练习。于是,我就在那台 08 年的 HP PC 上连续用了 5 年 7 个版本的 Ubuntu:10.04、11.10、12.04、12.10、13.04、13.10、14.04,直到今年 6 月份毕业。

Ubuntu 作为一个大众化的 Linux 发行版相比于 Windows 来说确实有很多优点:上手容易 + 界面美观而又轻巧。但是,在 Ubuntu 上不能轻松地使用 QQ,也不能完整地使用 Office,最基本的办公成了最麻烦的问题。

一晃眼,5 年时间过去了,世界发生了翻天覆地的变化:Linux 热潮已大幅度消减,取代而之的是智能手机、移动 OS 的天下。我的观念也发生了翻天覆地的变化:办公的基础是软件,而非 OS。在 Windows 平台寻找 putty 等软件的替代品显然比在 Linux 平台寻找 QQ、Office 等软件的替代品要容易得多。从今年 7 月份入职以来,我重新使用 Win7 作为自己办公的 PC 平台。经过两个月来的摸索,终于搜出了一些合口味的工具软件,能够让生信人非常舒服地办公。

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开始使用坚果铺子

以下更新于2020年

顽强的坚果铺子 -> 坚果云,功能越来越强大!运行状态也越来越稳定。十年来几乎没有出现过任何故障。2011 年刚开始使用时是作为“分享下载链接”的工具,但现在我已经作为文件同步工具的“网盘”来使用。

另外还有一个神奇的一点,坚果云是中国为数不多的只需要电子邮件即可注册的 app,无需验证手机号就可以使用全部功能。

在日本使用坚果云时网络连接也很稳定。

以下原作写于2011年

前段时间云诺的口号喊得很响,但是云诺有一个致命的缺陷:我分享的文件别人必须注册登陆才可以下载。那我要这玩意儿有什么用?还不如直接注册一个公共邮箱来得方便。

这段时间从坚果铺子的微博上搞到一个邀请号,开始使用坚果铺子,和云诺一样也支持Linux客户端。起初我图方便,使用网页操作界面上传并分享了一个文件,结果到其它电脑上一试:游客还是无法下载,必须登陆才能下载。

又到微博上抱怨了一番,这回居然有回应了:原来需要使用客户端来设置匿名分享,这回Linux客户端真的派上用场了。

坚果铺子将在本月底开放注册,届时看看大家的反应,我将慢慢地把博客中的一些下载链接转移到坚果铺子。

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