最近（2020年以来），Aspera（ascp）无法从NCBI下载SRA了，但是可以用ENA下载。现在以（SRR10609482）为例：
第一步：获取准确链接
访问https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SRR10609482，获取准确链接如下：
ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR106/082/SRR10609482/SRR10609482_1.fastq.gz
ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR106/082/SRR10609482/SRR10609482_2.fastq.gz可以看出中间出现了一个奇怪的三位数082。
第二步：打开防火墙33001端口
-I INPUT -p tcp --dport 33001 -j ACCEPT
-I OUTPUT -p tcp --dport 33001 -j ACCEPT第三步：下载
ascp -P 33001 -v -k 1 -T -l 300m -i XXX/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh era-fasp@fasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR881/002/SRR8815512/SRR8815512_1.fastq.gz .
# 注意最后一个参数（.）不要忘记了（指下载目标路径）这样子还有一个好处：下载下来的就是gzip压缩的FASTQ，无需从SRA解压。
那么，中间那个奇怪的三位数是什么？
通常情况下，它就是0+SRR ID的最后两位，例如本例是SRR10609482，那么中间三位数就是082。
但是，有时候会有例外，例如SRR8815512的中间三位数就是002，而不是012。即：00+SRR ID的最后一位。什么时候用哪个，这个规律我没找到。
所以我建议：两种 URL 都写上。如果 URL 错误导致文件不存在，它会自动跳过。
如果遇到错误？
如果看到下列错误：
Session Stop (Error: Failed to open TCP connection for SSH)
ascp: Failed to open TCP connection for SSH, exiting.这是说明对方服务器抽风了，等一段时间（有时是几个小时，有时是几天）即可。
最后更新于 2022 年 2 月 11 日 作者 springwood