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博客搬家到 VPS

背景

之前博客是放在香港的虚拟主机上,有些功能就用不了(例如对象缓存 Object Cache)。虽然也有过转移到 VPS 的想法,但香港的 VPS 用的人太多,时不时感觉不稳定。再加上付款周期还没到,就搁置了。

前几天在网上看到日本有冷门的 VPS(需要本地手机号和住址验证),走的 IIJ 线路。正好上面有个免费 14 天试用,就申请试了一下,感觉连接国内速度还行(不绕路),就决定正式申请了。顺便花了一天时间把博客搬了过来。

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从ENA下载SRA

最近(2020年以来),Aspera(ascp)无法从NCBI下载SRA了,但是可以用ENA下载。现在以(SRR10609482)为例,官方教程在此:

版本问题

目前 Aspera(ascp)最新的是4.2.X版,但是它有个问题是不存在 .aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh 这个文件,所以需要找老版本。遗憾的是官网下载老版本需要注册登录账号,因此这里提供一个 URL 解析的结果,下载 3.11.2 版:

https://d3gcli72yxqn2z.cloudfront.net/connect/bin/ibm-aspera-connect-3.11.2.63-linux-g2.12-64.tar.gz

第一步:获取准确链接

访问https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SRR10609482,获取准确链接如下:

ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR106/082/SRR10609482/SRR10609482_1.fastq.gz
ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR106/082/SRR10609482/SRR10609482_2.fastq.gz

可以看出中间出现了一个奇怪的三位数082

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